清明節連假高雄關服務不打烊，繼續辦理進出口貨物及郵包之通關業務，連假前一日（四月二日）一般進出口通關案件，除特殊案件外，均於當日處理完畢。

清明節連續假期（四月三日至六日）進出口貨物通關作業每日上午八時三十分至下午四時三十分止，如需辦理通關業務者，無需事先提出申請，可逕洽該關執勤人員（海運進口貨物通關集中於小港分關辦理）；上開時間辦理進出口貨物查驗，視同正常辦公時間，免徵收特別驗貨費。

儀檢作業每日上午九時至下午四時止，集中於第七十四號碼頭第五貨櫃中心儀檢站辦理。郵包通關作業配合郵局營業時間，業務一組高雄郵務股於四月三日及五日辦理國際郵包通關，作業時間上午七時三十分至下午三時三十分止；嘉南分關臺南郵務股於四月五日上午八時至十二時止，均派員值勤。海空運旅客通關作業，按船、機抵達及離境時間正常辦理通關。